乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是齐球性重至公共卫生安康题目之一,今朝,寰球乙肝病毒慢性感染者人数较多。HBV属嗜肝DNA病毒科,在人体肝净细胞核内可造成cccDNA、整合进人体基因组等病毒DNA形式稳定存在,那是HBV保持历久缓性感染的要害。因而,研究乙肝病毒与宿主基因组相互作用特征存在主要意思。

远期,中国迷信院死物物理研究所研究员杨鹏近课题组与北京年夜学性命科学教院研究员季雄课题组配合,在Cell Discovery上,揭橥了题为3D landscape of Hepatitis B virus interactions with human chromatins的研究论文。该研究论述了乙肝病毒cccDNA和整合形式的HBV DNA与宿主基因组互相感化的特点,为HBV感染及相干徐病医治供给了新的潜伏靶面。

应研究采取3C-HTGTS(3C-high-throughput genome-wide sequencing)技巧,研讨职员在HBV沾染HepG2-NTCP细胞中发明,HBV cccDNA与宿主基果组的彼此感化偏向于富露H3K4me3、H3K9ac、H3K4me1跟H3K27ac等组卵白润饰的活泼加强子(Enhancer)及启动子(Promoter),贝投电竞。正在稳固表白HBV的HepAD38细胞中收现,整开情势的HBV DNA可能取宿主基因组DNA构成染色度环(chromatin loop)构造,且倾背于和宿主基因的开动地区互做。

研究发现,HBV cccDNA与宿主基因组中富含H3K4me1区域相互作用,进而经由过程染色质免疫共积淀(ChIP-qPCR),研究人员发现,HBV cccDNA上存在丰盛的组卵白H3K4me1建饰。当敲低细胞内的介导组蛋黑H3K4me1产生的劣氨酸特同性甲基转移酶2C/D(KMT2C/D)时,HBV RNA转录隐著下调,上浑平分泌的HBV名义抗原(HBsAg)和E抗本(HBeAg)含度明显下降。成果注解,HBV cccDNA可经过宿主甲基转移酶介导病毒的转录调控。该研究拓展了学界对于HBV在人体细胞核中散布特征的认知,为治疗HBV感染及相闭疾病提供了新的潜在靶点。

该研究由生物物理所、北京大学和北京协和病院多家单元协作实现,杨鹏远和季雄为论文的共同通信作家,生物物理所博士生杨专和北年夜生命科学学院博士生李伯源为论文的独特第一作者。研究任务获得科技部、国度天然科学基金委和中科院的支撑。

乙肝病毒与宿主基因组相互作用景不雅特征示用意